Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms