Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930449I24RikQ9D5E3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930449I24RikQ9D5E3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930449I24RikQ9D5E3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930449I24RikQ9D5E3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms