Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zcchc13Q9D548 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zcchc13Q9D548 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms