Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syce1Q9D495 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syce1Q9D495 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syce1Q9D495 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms