Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efhc2Q9D485 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms