Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2lQ9D478 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms