Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933425L06RikQ9D3Z8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms