Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy3Q9D394 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy3Q9D394 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms