Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc8Q9D2H8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fndc8Q9D2H8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms