Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zbed3Q9D0L1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Zbed3Q9D0L1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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