Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms