Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spc24Q9D083 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spc24Q9D083 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms