Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shmt2Q9CZN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shmt2Q9CZN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms