Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm5Q9CXE0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms