Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Yif1bQ9CX30 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yif1bQ9CX30 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms