Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Utp23Q9CX11 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms