Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6kQ9CWP4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6kQ9CWP4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms