Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF6

Bbs2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs2Q9CWF6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bbs2Q9CWF6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bbs2Q9CWF6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms