Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp13a2Q9CTG6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp13a2Q9CTG6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms