Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms