Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931417E11RikQ9CR05 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms