Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim8Q9CQQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms