Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdm1Q9CQK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdm1Q9CQK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms