Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RTRAFQ9CQE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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