Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms