Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1ip1Q9CQ20 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms