Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim12aQ99PQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim12aQ99PQ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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