Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rad54l2Q99NG0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rad54l2Q99NG0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms