Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rims1Q99NE5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rims1Q99NE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms