Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Mrpl3Q99N95 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mrpl3Q99N95 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl3Q99N95 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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