Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms