Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp26Q99MX1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms