Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rassf1Q99MK9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms