Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkd1Q99MH6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkd1Q99MH6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms