Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprtQ99M80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprtQ99M80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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