Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdpd3Q99LY2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms