Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cstf3Q99LI7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms