Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RtcbQ99LF4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RtcbQ99LF4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms