Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf19Q99KJ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tcf19Q99KJ5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms