Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Krcc1Q99JT5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms