Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GatbQ99JT1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GatbQ99JT1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms