Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Def8Q99J78 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms