Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc8b1Q925Q3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms