Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn16Q925N4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Cldn16Q925N4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn16Q925N4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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