Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sntg1Q925E1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sntg1Q925E1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms