Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3b5Q923D4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms