Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Clip1Q922J3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms