Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb6Q922F4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb6Q922F4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubb6Q922F4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb6Q922F4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb6Q922F4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb6Q922F4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb6Q922F4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms