Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp4Q921I6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms