Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi2Q920Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi2Q920Q6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms